Структурно, ЦКОДУХЗ – Добрич се състои от следните функционално обособени блокове с общ капацитет от осемдесет (при необходимост и повече) деца месечно:
А. АМБУЛАТОРЕН БЛОК:
- Регистратура;
- Помещение за изчакване и престой на деца и родители;
- Специализирани консултативни и терапевтични кабинети;
- Манипулационна зала;
- Изолатор;
- Сектор за физикална терапия и рехабилитация с обособени помещения за лечебен масаж, ЛФК, кинезитерапия, електо-, топло- и водолечение, халотерапия;
- Помещения за обучение и групови занимания на деца / родители;
- Помещения за индивидуални занимания на деца / родители;
- Специално оборудвани зали – релационна психомоторика, мултисензорна, с Монтесори елементи, арт- и музикотерапия, биофийдбек;
- Кабинети за екипа, осъществяващ мобилни услуги;
- Помещение за съхранение на лекарствени продукти, медицински изделия апаратура и инвентар;
- Санитарни възли за персонал и пациенти;
- Помещения с осигурени условия за хранене, почивка и игра на децата;
- Помощни помещения;
Б. АДМИНИСТРАТИВНО – СТОПАНСКИ БЛОК:
- Администрация;
- Счетоводен отдел;
- Складово стопанство;
- Паро – котелно стопанство;
- Шофьор.
Всички структури на Центъра – клинични, социални, стопански, административни, работят в единство и функционална цялост за изпълнение на основните му дейности.